Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sp100O35892 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Sp100O35892 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Sp100O35892 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Sp100O35892 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sp100O35892 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
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