Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CaluO35887 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CaluO35887 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CaluO35887 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CaluO35887 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CaluO35887 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CaluO35887 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CaluO35887 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CaluO35887 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CaluO35887 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CaluO35887 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CaluO35887 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CaluO35887 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CaluO35887 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CaluO35887 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CaluO35887 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CaluO35887 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CaluO35887 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaluO35887 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaluO35887 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaluO35887 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CaluO35887 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaluO35887 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaluO35887 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaluO35887 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaluO35887 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CaluO35887 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CaluO35887 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaluO35887 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaluO35887 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CaluO35887 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaluO35887 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaluO35887 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaluO35887 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CaluO35887 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaluO35887 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaluO35887 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaluO35887 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaluO35887 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaluO35887 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaluO35887 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaluO35887 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaluO35887 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaluO35887 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CaluO35887 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CaluO35887 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms