Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms