Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Gm42836-201ENSMUST00000197198 728 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx8O35652 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx8O35652 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx8O35652 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms