Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp3O35609 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms