Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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