Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk4O35493 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk4O35493 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Clk4O35493 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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