Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc27a2O35488 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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