Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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TnxbO35452 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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TnxbO35452 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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TnxbO35452 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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TnxbO35452 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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TnxbO35452 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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TnxbO35452 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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TnxbO35452 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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TnxbO35452 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TnxbO35452 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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TnxbO35452 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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TnxbO35452 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TnxbO35452 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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TnxbO35452 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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