Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atf6bO35451 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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