Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kpna3O35344 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms