Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hs3st1O35310 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hs3st1O35310 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms