Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe40O35185 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms