Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1aO35134 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms