Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha8O09127 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epha8O09127 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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