Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms