Protein–RNA interactions for Protein: L7N280

Gm21962, Predicted gene, 21962, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21962L7N280 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21962L7N280 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms