Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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