Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20877J3QPZ4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms