Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc180J3QNE4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms