Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms