Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms