Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp408H7BX78 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms