Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms