Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef1G3X9K3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arfgef1G3X9K3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms