Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zc3h12bG3X9I7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3h12bG3X9I7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms