Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610008E11RikG3X964 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610008E11RikG3X964 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms