Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms