Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc6F8VPZ5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms