Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdh9F8VPK8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms