Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf169E9Q7F2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms