Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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DspE9Q557 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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DspE9Q557 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DspE9Q557 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms