Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms