Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tarbp1E9Q368 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms