Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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