Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Myo5cE9Q1F5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms