Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc1E9Q043 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc1E9Q043 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms