Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp54bE9PXC0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms