Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rsf1E9PWW9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsf1E9PWW9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms