Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms