Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7H8

Cilp2, Cartilage intermediate layer protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cilp2D3Z7H8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cilp2D3Z7H8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms