Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms