Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc6D3YZP9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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