Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cfap70D3YVL2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cfap70D3YVL2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap70D3YVL2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap70D3YVL2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap70D3YVL2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap70D3YVL2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap70D3YVL2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap70D3YVL2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap70D3YVL2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap70D3YVL2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap70D3YVL2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap70D3YVL2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap70D3YVL2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap70D3YVL2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap70D3YVL2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cfap70D3YVL2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms