Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Rfx8D3YU81 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Rfx8D3YU81 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfx8D3YU81 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Rfx8D3YU81 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Rfx8D3YU81 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rfx8D3YU81 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rfx8D3YU81 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx8D3YU81 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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