Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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