Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms