Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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