Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AU015836B2RUM3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms