Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc2B2RR83 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc2B2RR83 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc2B2RR83 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc2B2RR83 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc2B2RR83 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc2B2RR83 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc2B2RR83 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc2B2RR83 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc2B2RR83 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc2B2RR83 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc2B2RR83 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc2B2RR83 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc2B2RR83 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc2B2RR83 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc2B2RR83 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms